Es una especie de rana muy pequeña que se caracteriza por la siguiente combinación de caracteres (1): (1) piel del dorso ligeramente granulada con tubérculos cónicos, piel del vientre areolada con verrugas pequeñas de color verde en el pecho; pliegue discoidal ausente; pliegue dorsolateral ausente; (2) membrana y anillo timpánico presentes, su borde dorsoposterior converge con el pliegue supratimpánico; (3) hocico acuminado en vistal dorsal, protuberante en perfil lateral, con papila rostral; (4) párpado superior con varios tubérculos cónicos pequeños; crestas craneales ausentes; (5) procesos dentígeros del vómero ausentes; (6) macho con hendiduras vocales, ausencia de almohadillas nupciales; (7) dedo I más corto que el dedo II; discos de los dígitos expandidos, redondeados; (8) dedos con rebordes cutáneos; tubérculos subarticulares hiperdistales presentes; (9) tubérculos ulnares presentes, bajos y redondeados; (10) talón con tubérculos cónicos que varían de prominentes a discretos; pliegue tarsal interno ausente; (11) tubérculo metatarsal interno ovoide, elevado, cinco veces el tamaño del tubérculo metatarsiano externo redondo; presencia de tubérculos plantares supernumerarios; (12) dedos de los pies con rebordes cutáneos estrechos; ausencia de membranas basales en los dedos del pie; dedo del pie V mucho más largo que el dedo III (el disco del dedo III alcanza el borde proximal del penúltimo tubérculo subarticular del dedo IV, el disco del dedo V alcanza el tubérculo subarticular distal del dedo IV); presencia de tubérculos subarticulares hiperdistales; discos de los dedos del pie tan grandes como los de los dedos (1).

Las superficies dorsales del cuerpo y las extremidades son de color verde oliva o marrón oliva con marcas negras; franja cantal y pliegue supratimpánico negros; labios de color crema con barras negras; flancos crema con una amplia barra negra oblicua; pecho verde claro con verrugas crema verdosas; vientre blanco amarillento; iris de bronce a cobre rojizo con reticulaciones negras (1).

Habita en el bosque tropical amazónico, su hábitat se caracteriza por un dosel alto (hasta 30 metros) con árboles emergentes de hasta 40 metros. La pareja fue encontrada en amplexus en una hoja a 0.4 metros sobre el suelo en bosque primario cerca de un arroyo (1).  

Solo es conocida de su localidad tipo, los alrededores de villano, en el campamento petrolero AGIP en la provincia de Pastaza (1).

430 m sobre el nivel del mar

Pertenece al grupo de especies Pristimantis lacrimosus (4). Es la especie hermana de un clado formado por Pristimantis bromeliaceus, Pristimantis petersi y Pristimantis petersioides (1, 4)

El epíteto específico amaguanae es un patronímico en honor a Tránsito Amaguaña, figura líder del movimiento indígena en Ecuador. En 1930 ayudó a formar la primera organización indígena y durante su vida luchó por la igualdad y justicia de los ecuatorianos (1).